Realtime RT-PCR
本試劑盒是通過以高效率逆轉錄酶ReverTra Ace為逆轉錄酶和以Tth DNA Polymerase為PCR酶的兩酶體系,進行一步法熒光定量PCR的試劑盒。主要使用TaqMan分析法進行熒光定量PCR。因為逆轉錄反應與PCR在同一反應體系中連續進行,反應液的分裝操作一次就可以結束,適用于高通量分析。另外,樣品間交叉污染的危險性也降低了。本產品中,兩種酶與最優化過的buffer組分相組合,可以對微量RNA進行迅速定量。對RNA病毒及表達量低的mRNA的定量有利。另外,不易受目的基因序列的影響,可高靈敏度地檢測出各種各樣的RNA。
● 迅速?高靈敏度
通過使用Probe的One-step qRT-PCR,可迅速且高靈敏度地對微量RNA進行定量。
● 序列偏差的降低
不易受目的基因序列的影響,可高靈敏度地檢測出各種各樣的RNA。
將多重檢測(Multiplex)時各目的基因擴增的偏差降至最低。
●混雜物抗性的提高
可避免因血紅素等的PCR抑制劑導致的靈敏度下降。
●使用dUTP
通過添加Uracil-N-Glycosylase(UNG)*,能夠防止因Carryover污染而導致的假陽性發生。
* 本產品中不含有UNG。
原來的一步法的缺點 | 本試劑盒的改良點 |
●引物的優化比較困難 【高靈敏度比較困難】 ●容易產生因序列而導致的測定靈敏度偏差 | ●將因引物、探針或目的片段序列而引起的擴增偏差性影響抑制到了最小限度 →有利于各種各樣的病毒及mRNA的迅速、高靈敏度檢測或定量 |
●容易因RNA中的混雜物而引起靈敏度下降 | ●能夠避免因混雜物引起的抑制 |
●用TaqMan probe法難于進行多熒光分析 | ●將多重檢測中各目的片段擴增的偏差抑制到了最低限度 →最適于以管家基因作為對照的多數基因的相對定量等 |
1. 腸道病毒RNA的高靈敏度檢測
將腸道病毒RNA作4倍稀釋,使用TaqMan probe法,與其他公司的產品比較檢測靈敏度及定量性。引物、TaqMan probe是直接使用論文記載的序列(沒有進行優化處理)。用Applied Biosystems®、StepOnePlus™進行分析。
2. 各種病毒檢測靈敏度的比較
制備11種病毒RNA的4倍稀釋系列溶液,使用TaqMan probe法,進行最高檢測靈敏度的比較。引物、TaqMan probe是直接使用論文記載的序列。用Applied Biosystems®、StepOnePlus™進行分析。
將各試劑能檢測到的最低拷貝數連線作圖。
結果顯示:只有用本試劑盒時,才能對所有的目的基因以30個拷貝以下的靈敏度進行檢測及定量。通過這個實驗表明,本試劑不受目的片段序列的影響,能以高靈敏度檢測到各種各樣的RNA。
3. 多重熒光檢測(Multiplex)體系中的表達定量
使用三種熒光標記的TaqMan探針,分別用單獨檢測及一次使用三種TaqMan探針的多重熒光檢測體系,分析IL-1β、TNF-α、GAPDH基因的表達量。
實驗中以HeLa S3 RNA(1pg~100ng的10倍稀釋【6個梯度】)為樣品,用Roche Diagnositics公司的LightCycler 96進行分析。
結果顯示,各基因用單獨(圖1)及使用三通道的多重熒光檢測(圖2)分析中得到了相同的靈敏度,PCR效率及相關系數并沒有太大的差異(表1)。
產品內容
【QRZ-101】
2× Reaction Buffer1.25ml ×2支
DNA Polymerase125μl
RT Enzyme Mix125μl
50× ROX reference dye100μl
2× Reaction Buffer1.25ml ×2支
(50μl體系100次,或20μl體系250次)
【QRZ-101S】
2× Reaction Buffer500μl
DNA Polymerase25μl
RT Enzyme Mix25μl
50× ROX reference dye*20μl
2× Reaction Buffer500μl
(50μl體系20次,或20μl體系50次)
*ROX溶液是另外添加的,可以對應幾乎所有的熒光定量PCR檢測儀器。
基本反應條件
RNase free waterXμl
2×Reaction Buffer25μl
DNA Polymerase1.25μl
RT Enzyme Mix1.25μl
Forward Primer25pmol
Reverse Primer25pmol
TaqMan® probe10pmol
RNA溶液Yμl
50× ROX Reference dye*11/0.1μl
(Uracil-N-Glycosylase1unit*2)
Total Volume50μl
*1 50×ROX reference dye,是對于使用 Passive Reference 的儀器(如Applied Biosystems 公司制造的儀器等),為校正各孔間的熒光強度及分注誤差而使用。不用 Passive Reference 進行校正的儀器無需添加。
*2 使用Uracil-N-Glycosylase(UNG)處理時,請使用熱敏性(heat-labile)UNG??筛鶕鞴就扑]的條件,調整酶的用量。
Cycle
(20~25℃ 10min.*3)
↓
50℃ 10min.
↓
95℃ 1min.
↓
95℃ 15sec.
60℃ 45sec. 40~45 cycles
*3 進行UNG處理時,請在逆轉錄反應前,設定UNG反應步驟。上述表示的是一般溫度條件及反應時間,請根據各公司的推薦條件進行調整。