PCR
該產品是以改良型KOD DNA polymerase(UKOD)為基礎開發的PCR用2× Master Mix,兼具保真性好和擴增效率高的特點。
使用改進的延伸增強劑技術,可以實現超高速PCR反應:長度在1kb以內的片段僅需1秒, 1~10kb時延伸速度為5秒/kb,10kb及以上延伸速度為10秒/kb。該酶具有很高的反應成功率,針對含肌苷(dI)或尿嘧啶(dU)的引物模板或者粗體樣品都能很好地進行擴增。此外,因為預添加了抑制酶活性和3`5`外切酶活性的單抗,可以進行高特異性的熱啟動PCR。
●高速PCR
延伸時間設為1秒即可擴增1kb的片段,10kb以內延伸速度為5秒/kb,高于10kb的片段設為10秒/kb,縮短延伸時間可大幅提高PCR實驗的總耗時。 |
●簡便
除了引物和模板之外的PCR組分都包含在預混液中,簡化了配液流程,同時也提高了實驗的可重復性。此外,包含電泳指示劑的KOD OneTM PCR Master Mix –Blue-(Code No. KMM-201)可以在PCR反應完成后直接點樣,無需另外添加Loading Dye。
●超高的保真性
保真性約為Taq DNA 聚合酶的80倍,保持了KOD系列產品中保真性最高的水準
●粗樣品也可高效擴增(實驗例2)
●可以使用含肌苷(dI)或尿嘧啶(dU)的引物和模板(實驗例5)
1. 高速PCR實驗
以人基因組DNA為模板,可進行超快速PCR擴增。結果顯示,KOD OneTMPCR Master Mix及KOD OneTMPCR Master Mix -Blue-擴增1kb以下的目的片段時延伸時間設為1 sec.,1 ~10 kb的目的片段時按5 sec./ kb設定可以得到清晰的擴增條帶。
2.粗樣品擴增
使用KOD OneTMPCR Master Mix,比較從血液、鼠尾裂解液(堿裂解液)分別擴增人β-globin基因和小鼠Thy-1基因結果。反應根據各PCR酶推薦條件進行,延伸時間5 sec./ kb。
結果顯示,只有KOD OneTMPCR Master Mix能夠得到明確的條帶。
3.逆轉錄反應液(cDNA)的添加量對擴增的影響
逆轉錄反應液中殘留的RNA對PCR有抑制作用,過量添加cDNA模板會使擴增效果變差。KOD OneTMPCR Master Mix不易受RNA的抑制作用。為了確認可引入的cDNA的量,通過加入不同量的cDNA模板,檢測擴增TFR基因的效果。與原來的產品及其他公司的產品相比,即使添加較多的cDNA也能得到良好的擴增。
產品內容
【KMM-101】
Master Mix 1mL ×5支
【KMM-201】
Master Mix(含染料) 1mL ×5支
基本反應條件
滅菌蒸餾水X μl
KOD One PCR Maaster Mix25μl
各引物15pmoles each
模板1~50ng(Plasmid)
10~200ng(Genome DNA)
~750ng[RNA相當](cDNA)
~5μl(粗樣品)
Total Volume50μl
〈2步法循環〉*
98℃ 10sec.
68℃ 5~10sec./kb 25~45 cycles
〈3步法循環〉*
98℃ 10sec.
(Tm-5)℃ 5sec.
68℃ 1~10sec./kb 25~45 cycles
延伸時間請根據片段長度進行設定:
1~10 kb:5 sec./ kb
10 kb~:10 sec./ kb
〈Step down循環〉*
98℃, 10sec.
74℃, 1~10sec./kb 5 cycles
↓
98℃, 10sec.
72℃, 1~10sec./kb 5 cycles
↓
98℃, 10sec.
70℃, 1~10sec./kb 5 cycles
↓
98℃, 10sec.
68℃, 1~10sec./kb 15~25 cycles
*基本上以2步法循環進行。引物的Tm值低于68℃或用2步法循環未見擴增時,請試一下3步法循環。另外,擴增10kb以上的目的片段時,如果出現Long PCR片段或非特異條帶及彌散,請試一下Step down循環。 ※Tm值采用最鄰近法(Nearest Neighbor method)計算得到的值。
引物的Tm值以及擴增產物的Tm值計算請點擊此處進入在線工具