PCR
KOD -Plus- Neo在高保真性PCR酶KOD -Plus-系列技術的基礎上,應用了本公司新開發的「延伸增強劑」,保持了KOD -Plus-系列高保真性(約為Taq的80倍)的同時,通過抑制<停滯現象>,明顯提高了對微量模板DNA、長目的片段的擴增效率。
●可對微量模板DNA進行高保真?高效率的擴增
通過應用延伸增強劑技術,即便是微量模板DNA也可對目的基因進行高保真?高效率的擴增。同時本酶具備高保真性(約為Taq的80倍),可準確地對低拷貝數模板的目的基因進行擴增。
※PCR錯配率是通過使用各種酶以人基因組DNA為模板擴增β-globin基因(2.4kb),對PCR產物進行TA克隆后,對96個克隆進行測序分析,測得的結果。
●縮短了延伸時間<30sec./kb>(長目的片段更方便)
延伸時間從原產品的60sec./kb縮短到30sec./kb。對長目的片段的擴增更加方便。
●實現了各種引物同一循環條件
20mer以上的引物(Tm值>63℃)可先嘗試2步法。循環條件無需探討非常簡便。(請參考基本反應條件)
*Tm值采用最鄰近法(Nearest Neighbor method)計算得到的值。
●長目的片段的擴增
提高了延伸性,可對各種長度的目的片段進行擴增。已通過實驗確認可對24kb的基因組DNA進行擴增。
●采用熱啟動法,提高了PCR性能
KOD DNA polymerase具有強有力的3’→5’核酸外切酶活性(校正活性),可準確地對目的片段進行擴增,作為克隆用PCR酶獲得了廣泛的好評。 然而,高保真性PCR酶在20?30循環以后,容易出現擴增無法持續的<停滯現象>。
KOD -Plus- Neo在高保真性PCR酶:KOD -Plus-系列技術的基礎上,應用了本公司新開發的「延伸增強劑」,保持了KOD -Plus-系列高保真性(約為Taq的80倍)的同時,通過抑制<停滯現象>,明顯提高了對微量模板DNA、長目的片段的擴增效率。
1. Total RNA的各種基因全長ORF的擴增
以HeLa細胞來源的Total RNA逆轉錄后得到的cDNA(Total RNA 50 ng相當)為模板, 對各種蛋白激酶的ORF(open reading frame)的全長擴增。反應根據各PCR酶的推薦條件進行了30個循環。結果可見,只有用KOD -Plus- Neo的情況下,所有的基因都能得到明亮的擴增產物,所有的ORF都能迅速地進行克隆。
2. β-globin基因上各種長度區域的擴增效率?延伸性的比較
以人基因組DNA(50ng)為模板,對各種長度的β -globin 基因進行擴增。反應按各PCR 酶的推薦條件,進行了30個循環。結果顯示,只有用KOD -Plus- Neo 的情況下,17.5 kb 的片段能確認得到明亮的條帶。 而且,17.5 kb 以下的片段,用KOD -Plus- Neo 的得率要高得多。
產品內容
【KOD-401】
KOD -Plus- Neo (1U/μl)200μl ×1支
10×PCR Buffer for KOD -Plus- Neo [KOD-4B]1ml ×1支
25mM MgSO4[KOD-2S]1ml ×1支
2mM dNTP [NTP-201]1ml ×1支
※50μl反應體系的情況下可使用200次。
組分:
50mM Tris-HCl (pH8.0)
25mM KCI
0.1mM EDTA
1mM DTT
0.05% Tween®-20
0.05% Nonidet®P-40
50% Glycerol
活性的定義:
在75℃活性測定條件下,在30分鐘內攝入10nmoles的全核苷酸使成為酸不溶物時所需酶的活性定義為1U。
來源:
E.coli重組體
基本反應條件
滅菌蒸餾水X μl
2mM dNTPs5μl
25mM MgSO43μl
10pmol/μl Primer F1.5μl
10pmol/μl Primer R1.5μl
KOD -Plus- Neo (1.0U/μl)1μl
Genomic DNA~200ng
Plasmid DNA~50ng
cDNA~200ng(RNA相當)
10×PCR Buffer for KOD -Plus- Neo5μl
Total Volume50μl
〈2 Step Cycle〉*
94℃ 2min.
↓
98℃ 10sec.
68℃ 30sec./kb 25~45 cycles
〈3 Step Cycle〉*
94℃ 2min.
↓
98℃ 10sec.
Tm℃ 30sec.
68℃ 30sec./kb 25~45 cycles
〈Step Down Cycle〉*
94℃ 2min.
↓
98℃ 10sec.
74℃ 30sec./kb 5 cycles
↓
98℃ 10sec.
72℃ 30sec./kb 5 cycles
↓
98℃ 10sec.
70℃ 30sec./kb 5 cycles
↓
98℃ 10sec.
68℃ 30sec./kb 15~30 cycles
↓
68℃ 7min.
*引物的Tm值高于63℃的情況下,請用兩步法。
引物的Tm值在63℃以下,或用兩步法無法確認到擴增時,請嘗試用三步法。
此外,當擴增產物出現雜帶或彌散時,請嘗試Step down方法。
※Tm值采用最鄰近法(Nearest Neighbor method)計算得到的值。
引物的Tm值以及擴增產物的Tm值計算請點擊此處進入在線工具