Realtime PCRcDNA的合成
ReverTra Ace®qPCR RT Master Mix with gDNA Remover(Code No. FSQ-301)是使用高效率逆轉錄酶「ReverTra Ace®」開發的Realtime PCR用的逆轉錄試劑盒。是含有逆轉錄反應必需的全部組分的5x濃度的完全預混型試劑,只要添加模板RNA與水,就能迅速地開始反應。另外添加了能強力分解DNA的gDNA Remover,在逆轉錄反應前對模板RNA進行處理,就可以簡便地制備無基因組DNA的cDNA。最適用于待檢測目的基因中存在假基因,或在跨越內含子位置不能設計引物,以及模板RNA中殘存有基因組DNA污染等問題時的Realtime PCR實驗。
●與Realtime PCR試劑的配合性良好
采用了對RealtimePCR反應體系影響最小的組分,即使在PCR中添加最多20%的逆轉錄反應液,也可以得到很高的直線相關性。最適用于表達量低的mRNA的高靈敏度檢測。
●簡便、迅速地去除基因組DNA
只要依次添加去除基因組DNA的試劑和逆轉錄反應試劑,約20分鐘就可以制得不含基因組DNA的cDNA。
●完全預混型試劑
本品為放置于-20℃也不會凍結的完全預混型試劑。只要添加模板RNA和水,就可以簡便高效率地合成cDNA,且重復性良好。
●容易配制逆轉錄反應的陰性對照
因為添附有相同的預混型no-RT對照,能夠方便地配制逆轉錄反應的陰性對照。
●可得到更廣的可定量擴增區域
將Oligo dT 與Random Primer按最適比例預混,可均一、高效地在RNA全序列范圍內進行逆轉錄,因此可得到更廣的可定量擴增區域。
1. gDNA Remover對基因組DNA去除效果的確認
為了確認gDNA Remover對基因組DNA的去除效果,按以下條件進行了逆轉錄反應,接著以β-Actin為目的基因進行Realtime PCR。結果顯示,用gDNA Remover處理(+)、逆轉錄(-)<以下③>的條件時,沒有擴增出現,可以確認基因組DNA已被去除掉。
●cDNA合成
試劑:ReverTra Ace®qPCR RT Master Mix with gDNA Remover
模板:自己制備的HeLa total RNA 0.5μg /10μl反應體系
條件:使用gDNA Remover添加(+)、或無添加(-)的4x DN Master Mix,進行gDNA去除反應之后,分別用5x RT Master Mix II或5x RT Master Mix II no-RT Control進行逆轉錄反應。
●Realtime PCR
試劑:THUNDERBIRD®SYBR®qPCR Mix (Code No.QPS-201)
模板:上述cDNA2μl/20μl反應體系(添加量10%)
Target:ACTB(188bp)
測定:Applied Biosystems 7900HT
2.與其他公司同類型產品基因組DNA去除能力的比較
在HeLa total RNA中添加過量的人基因組DNA,與其他公司同類型試劑盒進行基因組DNA去除能力的比較模擬實驗。結果顯示,ReverTra Ace®qPCR RT Master Mix with gDNA Remover在基因組DNA去除方面效果更加明顯。
●cDNA合成
試劑:ReverTra Ace®qPCR RT Master Mix with gDNA Remover(Code No.FSQ-301)及同類型其他公司的試劑盒2種
模板:HeLa total RNA(0, 1pg, 10pg, 100pg, 1ng, 10ng, 100ng, 1μg)+ 人 gDNA 100ng/20ul反應體系
條件:按各公司試劑盒的推薦條件進行
●Realtime PCR
試劑:THUNDERBIRD®SYBR®qPCR Mix(Code No.QPS-201)
模板:上述cDNA 2μl/20μl反應體系(添加量10%)
Target:ACTB(188bp)
測定:Applied Biosystems 7900HT
產品內容
gDNA Remover 10μl×1支
4x DN Master Mix 440μl×1支
5x RT Master Mix II 400μl×1支
5x RT Master Mix II
no-RT Control [FSQ-301NC] 40μl×1支
Nuclease-free Water 1,000μl×2支
※10μl反應體系情況下,可以使用200次。
注意事項
本試劑盒中附帶的5x RT Master Mix II與本公司的姊妹產品ReverTra Ace® qPCR RT Master Mix(Code No.FSQ-201)中含有的5x RT Master Mix組成不同。
請務必使用本試劑盒附帶的5x RT Master Mix II。
基本反應條件
(RNA的變性)
RNA在65℃處理5min.
↓
置于冰上
(gDNA去除反應(DNase反應))
Nuclease-free Water Xμl
4x DN Master Mix
(gDNA Remover 添加完畢) 2μl
RNA template 0.5pg~0.5μg
Total volume 8μl
↓
37℃, 5min.
(4℃)
(cDNA合成)
上述反應液 8μl
5x RT Master Mix II 2μl
Total volume 10μl
↓
37℃, 15min.
98℃, 5min.
4℃, hold.