Realtime PCR用cDNA的合成
ReverTra Ace® qPCR RT Master Mix(Code No. FSQ-201)是利用本公司高性能逆轉錄酶『ReverTra Ace®』開發的Realtime PCR用的逆轉錄試劑盒,是包含逆轉錄反應用的所有組分的5×濃度的完全預混型試劑,只需添加模板RNA和水即可迅速地開始反應。另外,由于采用了最適用于Realtime PCR用短鏈目的片段cDNA合成的反應組分,可在短時間內高效率地制備適用于Realtime PCR的cDNA模板。
ReverTra Ace®qPCR RT試劑盒(Code No.FSQ-101)采用了本公司高性能逆轉錄酶『ReverTra Ace®』,反應效率非常出色。另外,通過改良,使得帶入到Realtime PCR反應體系中的逆轉錄反應液的影響降到最小,即使在PCR反應體系中添加20%體積的逆轉錄反應液,也能表現出良好的擴增線性。因此,最適合用于表達量較少的mRNA的高靈敏度檢測。由于精簡了試劑盒的構成,可非常簡便地進行操作。
●可得到更廣的可定量擴增區域
將Oligo dT 與Random Primer按最適比例預混,可均一、高效地在RNA全序列范圍內進行逆轉錄,因此可得到更廣的可定量擴增區域。
●與RealtimePCR試劑的配合性良好
采用了對RealtimePCR反應體系影響最小的組分,即使在PCR中添加最多20%的逆轉錄反應液,也可以得到很高的直線相關性。最適用于表達量少的mRNA的高靈敏度檢測。
●完全預混型試劑(僅FSQ-201)
本品為放置于-20℃也不會凍結的完全預混型試劑。只要添加模板RNA和水,就可以簡便高效率地合成cDNA,且重復性良好。
●容易配制逆轉錄反應的陰性對照(僅FSQ-201)
因為添附有相同的預混型no-RT對照,能夠方便地配制逆轉錄反應的陰性對照。
1.模板RNA量的添加量對合成效率影響的探討
在ReverTra Ace® qPCR RT Kit的反應體系(10μl)中,分別添加HeLa細胞來源的total RNA 0.5μg - 0.5pg,分別進行逆轉錄反應。然后,采用和實驗例2同樣的方法進行cDNA合成量的比較。結果可見,在探討的范圍內,模板RNA的量和cDNA的得率密切相關,但無論模板RNA量的多寡,仍可維持很高的cDNA合成效率。由此可見,在目的片段濃度有差異的樣品之間,逆轉錄反應效率的變化并不大,因此可將定量結果的誤差控制在最小范圍內。
2.與用其他公司產品cDNA合成量的比較
以來源于HeLa細胞的total RNA 100ng為模板,根據各公司試劑盒推薦的條件進行逆轉錄反應。然后,在Realtime PCR反應液(使用本公司SYBR Green Realtime PCR Master Mix)中分別添加上述的逆轉錄反應液各1% (V/V),用Realtime PCR對β-Actin和Polymerase ε的cDNA量進行定量。結果可見,在使用本試劑盒的情況下,兩個目的片段都有最高的得率。3. RNase H 處理與否對檢測靈敏度影響的比較以來源于HeLa細胞的total RNA 100ng為模板,使用ReverTra Ace® qPCR RT Kit(藍線)及另外添附RNase H的B公司cDNA合成試劑盒,按各自推薦的實驗步驟進行逆轉錄反應(B公司試劑盒分別按RNase H處理(紅線)/未處理(橙線)兩種方法進行)。然后,按和實驗例1同樣的方法檢測β-Actin的擴增效果。結果顯示,用B公司的試劑盒RNase H未處理(橙線)的情況下,檢測效果大幅下降。而用ReverTra Ace® qPCR RT Kit(藍線)進行反應,即便不追加RNase H處理也能顯示出很高的擴增效率。已經過實驗證明,用本試劑盒RNase H處理與否靈敏度相等。
※本試劑盒不包含RNase H處理步驟。
4.與其他公司預混型cDNA合成試劑的逆轉錄效率(cDNA合成量)的比
以HeLa total RNA 100ng為模板,按各公司試劑盒推薦條件進行逆轉錄,然后進行Realtime PCR對5種目的基因進行定量。結果顯示,使用本試劑盒的cDNA得率更高。
●cDNA合成
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產品內容
[FSQ-101]
5x RT Buffer 400μl
Enzyme Mix 100μl
Primer Mix 100μl
Nuclease-free Water 1000μl×2支
[FSQ-201]
5x RT Master Mix 400μl×1支
5x RT Master Mix no-RT Control 40μl×1支
Nuclease-free Water 1,000μl×2支
※各試劑盒均為10μl反應體系情況下,可以使用200次。
注意事項
本試劑盒中附帶的5x RT Master Mix 及 5x RT Master Mix no-RT Control不能用在本公司的姊妹產品 ReverTra Ace® qPCR RT Master Mix with gDNA Remover (Code No. FSQ-301)中〔組分不同〕。
請務必注意。
基本反應條件
[FSQ-101]
將RNA置于65℃,5min.
↓
置于冰上
滅菌蒸餾水 X μl
5x RT Buffer 2 μl
Enzyme Mix 0.5 μl
Primer Mix 0.5 μl
RNA 0.5pg~1μg
Total Volume 10 μl
↓
37℃, 15min.
98℃, 5min.
[FSQ-201]
將RNA置于65℃,5min.
↓
置于冰上
Nuclease-free Water Xμl
5x RT Master Mix 2μl
RNA template 1pg~1μg
Total volume 10μl
↓
37℃, 10min.
50℃, 5min.
98℃, 5min.
4℃, hold.